298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0528 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
354 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  54.31 
 
 
366 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  54.49 
 
 
345 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  55.2 
 
 
344 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.69 
 
 
359 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  55.1 
 
 
349 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  53.73 
 
 
371 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  50.73 
 
 
355 aa  352  7e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  50.88 
 
 
350 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  46.11 
 
 
358 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  48.08 
 
 
373 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  41.72 
 
 
342 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  41.86 
 
 
352 aa  260  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  39.17 
 
 
375 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  37.97 
 
 
374 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  33.78 
 
 
373 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.26 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  32.87 
 
 
362 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 
340 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.85 
 
 
395 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.89 
 
 
357 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  35.13 
 
 
359 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32 
 
 
404 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
361 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
389 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.1 
 
 
397 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
438 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
652 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
423 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
319 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.07 
 
 
415 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
423 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
415 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.37 
 
 
381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
424 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
671 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
360 aa  116  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.96 
 
 
406 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.53 
 
 
313 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.32 
 
 
387 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.41 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
320 aa  110  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.99 
 
 
362 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 
468 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
313 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.15 
 
 
310 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 
399 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
657 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
334 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
318 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.28 
 
 
488 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
434 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
434 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.49 
 
 
431 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
323 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
465 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.94 
 
 
443 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.26 
 
 
418 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.26 
 
 
418 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  25.26 
 
 
446 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
365 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
313 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
361 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  26.84 
 
 
345 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
406 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 
308 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  24.53 
 
 
420 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.9 
 
 
312 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 
686 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.74 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.98 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 
698 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.52 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
317 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  22.96 
 
 
689 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.25 
 
 
405 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.1 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  26.02 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  23.03 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 
662 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 
370 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  23.31 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  24.18 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>