More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0372 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
385 aa  799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  65.62 
 
 
387 aa  521  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  45.5 
 
 
398 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  44.68 
 
 
381 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  35.11 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  34.37 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 
365 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.16 
 
 
357 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
373 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 
415 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.85 
 
 
362 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
342 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.49 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.15 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.66 
 
 
434 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.94 
 
 
352 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.5 
 
 
431 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  31.02 
 
 
395 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.86 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.74 
 
 
370 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
349 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  32.72 
 
 
468 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
438 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
446 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  32.13 
 
 
406 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.3 
 
 
405 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
415 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  40.1 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.44 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 
686 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
689 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
371 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
698 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
465 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
420 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
358 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.99 
 
 
359 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.6 
 
 
395 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
393 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
657 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.16 
 
 
313 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 
402 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.64 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.03 
 
 
375 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
429 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  28.07 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 
354 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.11 
 
 
415 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 
366 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  31.36 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 
419 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  38.32 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.54 
 
 
489 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  26.85 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
423 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
671 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
652 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.59 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
358 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 
454 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
390 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
361 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 
313 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.94 
 
 
450 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  35.57 
 
 
283 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
474 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  37.5 
 
 
438 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 
358 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
446 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25 
 
 
404 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.86 
 
 
397 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.86 
 
 
362 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  34.01 
 
 
500 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
355 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
460 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
460 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  35.94 
 
 
632 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
313 aa  106  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>