272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0606 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 355 aa  733    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  53.71 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  54.23 
 
 		 345 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  53.67 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  53.51 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  52.27 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  57.48 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.73 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.57 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  51.25 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  50.73 
 
 		 354 aa  352  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  42.94 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  41.76 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  36.68 
 
 		 375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  36.52 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  38.14 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  34.72 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.34 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  35.76 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.81 
 
 		 404 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.57 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.09 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.15 
 
 		 397 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 652 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.05 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  23.18 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.53 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.63 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  24.7 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.89 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 		 689 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.8 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.73 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 		 310 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  26.02 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.68 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 468 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.18 
 
 		 686 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  24.69 
 
 		 698 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.22 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 		 488 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 		 438 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.36 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.32 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 		 671 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.32 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.39 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 		 309 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.69 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  25.26 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.67 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  27.57 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.22 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  21.96 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  22.44 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  21.03 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  21.35 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  22.81 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>