237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0938 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 355 aa  717    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  93.52 
 
 		 366 aa  679    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  93.22 
 
 		 367 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  43.73 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  40.73 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  41.94 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  42.65 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  41.74 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  43.89 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  39.49 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  38.4 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.69 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.53 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  25.84 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.71 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 		 415 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  24.43 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  24.45 
 
 		 361 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.43 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.46 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.11 
 
 		 415 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  24.09 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  23 
 
 		 423 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  25.5 
 
 		 468 aa  95.9  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  23.99 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  24.59 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  23 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  26.71 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.77 
 
 		 431 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  23.47 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.58 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  23.68 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  24.8 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  23.52 
 
 		 446 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  22.58 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  22.6 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  23.26 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  24.66 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  23.31 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  24.23 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  22.54 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  23.96 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  23.85 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  21.8 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.7 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  22.55 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  29.71 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.63 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.46 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  23.21 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.05 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  22.17 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  25.13 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  26.64 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  22.52 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  30.24 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  23.5 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  22.69 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.42 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  21.21 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.41 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  22.86 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  23.76 
 
 		 632 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  25.47 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  22.28 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  23.02 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  23.68 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.75 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  22.82 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  24.01 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.78 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  23.6 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  23.51 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  20.39 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>