More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_257 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 365 aa  753    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  47.23 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  41.6 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  41.59 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  37.96 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  40.99 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  36.83 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  37.65 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  37.57 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  37.94 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  38.14 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  35.26 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  39.03 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  36.34 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  35.92 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  35.68 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  33.61 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  35.71 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.6 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  34.56 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.22 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.9 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  35.42 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.18 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.93 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.65 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  34.13 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.15 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  34.11 
 
 		 468 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 		 318 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  32.97 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  34.58 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.39 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  33.62 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  34.16 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.44 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  34.65 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.96 
 
 		 671 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.81 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.18 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.83 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 		 652 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 		 657 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 		 421 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.67 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.68 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  32.24 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.51 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 		 434 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.12 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.2 
 
 		 431 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  37.16 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  38.51 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 		 415 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3525  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.94 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124097  hitchhiker  0.00602561 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  34.87 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.65 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.36 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.65 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 		 452 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 		 508 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  36.99 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  28.95 
 
 		 615 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  34.86 
 
 		 446 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.24 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.84 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 		 283 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  24.81 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>