More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0535 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 357 aa  739    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  37.88 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  35.31 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  36.08 
 
 		 389 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  36.77 
 
 		 415 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  33.1 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  37.26 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  36.14 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  35.01 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  35.01 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  35.94 
 
 		 388 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  36.75 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  36.23 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  32.45 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 		 657 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 468 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.59 
 
 		 671 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  32.07 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 		 652 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.12 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.65 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.92 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  33.15 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.73 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.08 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  36.32 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  35.25 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  33.07 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.65 
 
 		 365 aa  169  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.25 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  31.17 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  32.14 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  34.02 
 
 		 443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  31.71 
 
 		 371 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  34.83 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.61 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  33.05 
 
 		 438 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.44 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 		 474 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 		 308 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  34.75 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  32.02 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 		 465 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.15 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 423 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  32.49 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  29.4 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  31.99 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 686 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.57 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 		 698 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  31.6 
 
 		 689 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 420 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  30.07 
 
 		 438 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  32.19 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.04 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.64 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  31.77 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.7 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.36 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  31.45 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.72 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.97 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.94 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  28.93 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 632 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  39.06 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.73 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  29.25 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.01 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>