More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1243 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 325 aa  657    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  63.14 
 
 		 313 aa  417  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  50 
 
 		 320 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  55.66 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  50.46 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  51.85 
 
 		 318 aa  289  4e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  53.06 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  50.33 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  42.5 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  41.94 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  41.27 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  34.83 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.49 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.55 
 
 		 421 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.53 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.43 
 
 		 431 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 434 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.46 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.16 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.64 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.52 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.86 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.04 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 468 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.41 
 
 		 361 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 		 335 aa  123  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.69 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.61 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.43 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.97 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.52 
 
 		 632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.06 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 		 698 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.86 
 
 		 406 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  25.42 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  28.29 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.72 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 		 414 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  24.16 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 		 377 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.4 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.64 
 
 		 387 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.42 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 		 662 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  28.2 
 
 		 370 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  25.43 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  34.41 
 
 		 385 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.46 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 		 379 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.18 
 
 		 460 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>