More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0989 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
418 aa  878    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
418 aa  878    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  64.51 
 
 
431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  63.36 
 
 
434 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  65.2 
 
 
415 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  63.66 
 
 
421 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  52.68 
 
 
443 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  50.49 
 
 
431 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  49.03 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.23 
 
 
415 aa  245  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.3 
 
 
375 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 
377 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  36.29 
 
 
361 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  35.83 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  35.88 
 
 
358 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  36.27 
 
 
358 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.01 
 
 
357 aa  196  8.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.51 
 
 
395 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
671 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 
652 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.72 
 
 
373 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
389 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
438 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
320 aa  159  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
390 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
657 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 
468 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.03 
 
 
406 aa  153  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
355 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 
325 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 
698 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
412 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  31.2 
 
 
388 aa  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.02 
 
 
387 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 
686 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
689 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.75 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
308 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
356 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.88 
 
 
450 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.78 
 
 
381 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
424 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
440 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 
360 aa  144  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
440 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
415 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 
464 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
446 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.43 
 
 
370 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.06 
 
 
405 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
362 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.53 
 
 
362 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
361 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.27 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
465 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.95 
 
 
362 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
328 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  29.2 
 
 
518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
423 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
309 aa  126  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
452 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.75 
 
 
440 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.43 
 
 
501 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  33.58 
 
 
508 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.33 
 
 
468 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  32.83 
 
 
399 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
310 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
406 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 
368 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  34.09 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  37.91 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
662 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.1 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.42 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  35.98 
 
 
632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  27.31 
 
 
423 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  28.31 
 
 
352 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
358 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
317 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>