More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4810 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
379 aa  779    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  59.44 
 
 
323 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  44.35 
 
 
386 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  41.76 
 
 
370 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  45.21 
 
 
371 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  40.44 
 
 
313 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  40.06 
 
 
313 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  42.36 
 
 
350 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  40.13 
 
 
308 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  39.94 
 
 
345 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  39.2 
 
 
313 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  39.41 
 
 
350 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  43.73 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
368 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  36.51 
 
 
310 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  36.5 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.42 
 
 
328 aa  157  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.62 
 
 
361 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.11 
 
 
398 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  35.07 
 
 
468 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  46.67 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.14 
 
 
405 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  33.84 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.43 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 
398 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
335 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.16 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.36 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  31.01 
 
 
381 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
652 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  29.39 
 
 
320 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.29 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.75 
 
 
356 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
337 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.29 
 
 
489 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
727 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.97 
 
 
388 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
399 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 
395 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
331 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
365 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.7 
 
 
416 aa  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.26 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
671 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
415 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.08 
 
 
395 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 
414 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 
390 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  28.21 
 
 
657 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.99 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 
329 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.77 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.82 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
342 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.93 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.42 
 
 
429 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
421 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  30.87 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.55 
 
 
689 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
393 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
434 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.57 
 
 
350 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
385 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.93 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
420 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  33.65 
 
 
462 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
320 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.01 
 
 
350 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.38 
 
 
312 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
454 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
418 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.71 
 
 
375 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
418 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.69 
 
 
686 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
325 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
632 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>