More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0022 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
465 aa  963    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  45.28 
 
 
361 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  46.26 
 
 
362 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  45.45 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.79 
 
 
423 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.87 
 
 
423 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
438 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.98 
 
 
405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.32 
 
 
357 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
406 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.56 
 
 
313 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
356 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.89 
 
 
313 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 
412 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.22 
 
 
310 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.41 
 
 
395 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.87 
 
 
406 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
429 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
374 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
323 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
371 aa  136  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.9 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  25.67 
 
 
652 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
371 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.53 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
375 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.06 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.16 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.79 
 
 
434 aa  129  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
325 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
358 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
415 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
399 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
385 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
373 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
359 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
379 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
355 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
361 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  29.72 
 
 
409 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
446 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 
335 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 
318 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  26.37 
 
 
345 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
400 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
313 aa  124  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 
366 aa  123  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  24.54 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
313 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
320 aa  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
395 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
348 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 
437 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  28.07 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.21 
 
 
381 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  24.73 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.61 
 
 
686 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.5 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 
331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
689 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.94 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
342 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
318 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
415 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
698 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
360 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 
309 aa  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
727 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  25.47 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  25.97 
 
 
424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  24.05 
 
 
355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
662 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 
349 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.89 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.54 
 
 
359 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  25.97 
 
 
371 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
671 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
399 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 
454 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.2 
 
 
345 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
365 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.64 
 
 
362 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 
398 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>