291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04441 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  83.48 
 
 
686 aa  1175    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  82.79 
 
 
698 aa  1179    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
689 aa  1429    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  38.41 
 
 
671 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  38.2 
 
 
652 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
657 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 
500 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
452 aa  164  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
373 aa  157  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  30.46 
 
 
468 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.1 
 
 
501 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
508 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.84 
 
 
492 aa  154  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.02 
 
 
415 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.6 
 
 
357 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.5 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
421 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 
474 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.5 
 
 
388 aa  144  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.86 
 
 
395 aa  145  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
424 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.33 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
434 aa  138  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.03 
 
 
431 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 
371 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
342 aa  130  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.94 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
389 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.25 
 
 
415 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
385 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
440 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
440 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.06 
 
 
406 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
361 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.56 
 
 
387 aa  124  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
399 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.29 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
488 aa  122  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
358 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.98 
 
 
405 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
370 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
375 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
423 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 
368 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
465 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 
361 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.63 
 
 
313 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
632 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 
398 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 
438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  25.76 
 
 
517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
415 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
423 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
390 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.15 
 
 
381 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
374 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
340 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.85 
 
 
362 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
508 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
446 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.13 
 
 
313 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 
334 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.36 
 
 
397 aa  108  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 
412 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 
434 aa  107  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.06 
 
 
404 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.79 
 
 
375 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
335 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 
362 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.95 
 
 
364 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
379 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.41 
 
 
308 aa  104  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  23.23 
 
 
361 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  25.71 
 
 
440 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.99 
 
 
350 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
365 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
323 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
377 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.24 
 
 
359 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
429 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 
355 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
358 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
423 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 
454 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 
402 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
359 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.32 
 
 
328 aa  100  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
358 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
373 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
355 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  25.38 
 
 
462 aa  99.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.4 
 
 
405 aa  98.2  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>