286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2562 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 423 aa  875    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  51.9 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  36.18 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  31.74 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 		 535 aa  193  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 502 aa  182  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 		 508 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 		 657 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.45 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 652 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.55 
 
 		 671 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 474 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  30.72 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 689 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 		 373 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  26.67 
 
 		 468 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 		 698 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 686 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.04 
 
 		 313 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  51.35 
 
 		 517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.83 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.22 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.9 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  29.4 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.89 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.31 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.31 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 		 360 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  25.83 
 
 		 342 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  26.65 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.48 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  28.5 
 
 		 352 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.85 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 		 355 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  26.62 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 		 370 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  25.6 
 
 		 632 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  23.93 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.1 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25.53 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.3 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.22 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.59 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  25.3 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 371 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  27.15 
 
 		 518 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.62 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.94 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  24.95 
 
 		 393 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  24.72 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.02 
 
 		 364 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.53 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.63 
 
 		 501 aa  90.1  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 		 370 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  23.46 
 
 		 399 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  45.13 
 
 		 508 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  25.56 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>