298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0766 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
488 aa  1008    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  41.59 
 
 
395 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  38.89 
 
 
373 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.1 
 
 
357 aa  212  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
424 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  32.49 
 
 
389 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  33.89 
 
 
355 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 
438 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 
440 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 
440 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  31.74 
 
 
434 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.95 
 
 
388 aa  153  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.7 
 
 
489 aa  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 
415 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 
508 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.05 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  31.31 
 
 
500 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  28.84 
 
 
492 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.7 
 
 
431 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 
421 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 
371 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
657 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 
511 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
434 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.76 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.64 
 
 
443 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 
423 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  25.76 
 
 
671 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  26.71 
 
 
474 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
361 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
698 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  27.29 
 
 
502 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.8 
 
 
387 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
375 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
686 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.07 
 
 
501 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  29.38 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  26.86 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
358 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
415 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
535 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
689 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
349 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.8 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.94 
 
 
362 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
446 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.51 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  23.63 
 
 
520 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 
652 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  37.06 
 
 
310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.56 
 
 
361 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.13 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.87 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  34.27 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.37 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  36.6 
 
 
308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
345 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.72 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.2 
 
 
350 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 
390 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  35.1 
 
 
313 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
371 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26 
 
 
415 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.41 
 
 
359 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
395 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
468 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  25.28 
 
 
354 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.4 
 
 
412 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 
462 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
317 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  25.75 
 
 
352 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
464 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  26.05 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
508 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 
373 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 
365 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  24.04 
 
 
319 aa  103  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 
435 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  33.67 
 
 
385 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
358 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
409 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.02 
 
 
328 aa  101  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.31 
 
 
362 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.77 
 
 
313 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
366 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.88 
 
 
362 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>