211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4264 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
508 aa  1049    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  46.72 
 
 
517 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  43.45 
 
 
535 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  44.51 
 
 
520 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  41.78 
 
 
502 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  41.28 
 
 
511 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.96 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 
652 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  23.93 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  25.34 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  22.38 
 
 
489 aa  117  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  43.62 
 
 
423 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
689 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
488 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.51 
 
 
395 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.91 
 
 
357 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  42.07 
 
 
420 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.62 
 
 
406 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  25.88 
 
 
468 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  24.95 
 
 
492 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.04 
 
 
501 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  45.45 
 
 
671 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  46.07 
 
 
686 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  46.07 
 
 
698 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  22.96 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  26.86 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.2 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  45.78 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  24.02 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  21.73 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  21.73 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  23.7 
 
 
464 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00245  site-specific DNA-methyltransferase  25.56 
 
 
735 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  45.78 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  37.61 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  24.91 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  45.57 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  38.14 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.11 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.05 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  45.35 
 
 
423 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
366 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.51 
 
 
313 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  43.68 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 
402 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  46.75 
 
 
342 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  24.8 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
313 aa  64.7  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2975  hypothetical protein  58 
 
 
104 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
472 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.66 
 
 
421 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
334 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  41.56 
 
 
438 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  39.58 
 
 
399 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
355 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.31 
 
 
398 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  45.21 
 
 
309 aa  63.5  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  43.14 
 
 
415 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  31.38 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
462 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  48.53 
 
 
359 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  26.81 
 
 
471 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  52.46 
 
 
355 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.24 
 
 
405 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  40.96 
 
 
399 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  25.4 
 
 
437 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  39.39 
 
 
371 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
409 aa  61.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  49.23 
 
 
424 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
320 aa  60.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  43.66 
 
 
308 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  52.08 
 
 
360 aa  60.5  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 
440 aa  60.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 
440 aa  60.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 
476 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  23.61 
 
 
349 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.58 
 
 
520 aa  60.1  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 
323 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  26.82 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  38.1 
 
 
435 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 
370 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  26.82 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  26.82 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  38.37 
 
 
368 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  26.82 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  24.31 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
434 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
465 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>