287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2193 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  99.36 
 
 		 472 aa  982    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  100 
 
 		 472 aa  988    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  82.81 
 
 		 476 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  82.6 
 
 		 476 aa  801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  99.15 
 
 		 472 aa  981    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  98.73 
 
 		 472 aa  976    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  83.02 
 
 		 476 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  83.02 
 
 		 476 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  80.22 
 
 		 471 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  82.6 
 
 		 476 aa  802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  68.3 
 
 		 491 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  99.36 
 
 		 472 aa  982    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  99.15 
 
 		 472 aa  980    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  99.15 
 
 		 472 aa  980    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  69.32 
 
 		 474 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  63.01 
 
 		 447 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  49.46 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  53.25 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  51.49 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  53.71 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  52.85 
 
 		 419 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  53.54 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  53.18 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  52.77 
 
 		 406 aa  363  5.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  51.89 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  51.54 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  50.92 
 
 		 487 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  48.61 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  48.93 
 
 		 323 aa  306  8.000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  41.05 
 
 		 305 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.05 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  40.11 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  39.43 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  38.36 
 
 		 417 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  39.57 
 
 		 416 aa  213  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  35.4 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  35.64 
 
 		 329 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  36 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  35.05 
 
 		 327 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  34.83 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  33.87 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  33.6 
 
 		 318 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  33 
 
 		 727 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.71 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 		 311 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  29.66 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  39.91 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.63 
 
 		 657 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 		 319 aa  140  7e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 		 336 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.25 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  39.55 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  35.61 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.96 
 
 		 313 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  27.69 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.02 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.09 
 
 		 313 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  33.18 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  33.18 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 		 334 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  32.82 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  34.33 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 		 368 aa  99.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.54 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 		 490 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  33.18 
 
 		 239 aa  97.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  24.82 
 
 		 392 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.33 
 
 		 348 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  32.87 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 372 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 483 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.55 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.7 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 		 335 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  24.18 
 
 		 335 aa  86.7  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  26.35 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.94 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>