More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0145 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  859    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  58.11 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  56.37 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  58.46 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  53.21 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  53.68 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  57.29 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  55.31 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  56.23 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  61.81 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  58.64 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  55.08 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  60.24 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  51.47 
 
 		 474 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  49.66 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  49.77 
 
 		 447 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  52.39 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  52.39 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  52.39 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  52.39 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  52.39 
 
 		 472 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  52.39 
 
 		 472 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  51.89 
 
 		 472 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  50.62 
 
 		 471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  50.63 
 
 		 476 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  49.75 
 
 		 476 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  50.63 
 
 		 476 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  50.63 
 
 		 476 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  50.63 
 
 		 476 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  50 
 
 		 305 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  50.45 
 
 		 328 aa  279  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  42.71 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  41.69 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  44.19 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  43.33 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  42.41 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  42.52 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  40.96 
 
 		 338 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  41.4 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  41.98 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  39.51 
 
 		 311 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  38.01 
 
 		 318 aa  203  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.84 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 		 727 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  37.22 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  37.43 
 
 		 336 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  34.56 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.27 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  34.7 
 
 		 373 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  31.55 
 
 		 495 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  49.46 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  44.55 
 
 		 657 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.69 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.46 
 
 		 313 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  34.62 
 
 		 423 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  33.23 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.58 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.13 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  38.61 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  43.93 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  42.78 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  42.78 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  31.99 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  30.11 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  35.16 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.63 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 		 310 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  32.6 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  35.82 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 		 360 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  34.72 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.61 
 
 		 315 aa  110  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.34 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.57 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.55 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  36.56 
 
 		 239 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.37 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.48 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 		 383 aa  100  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>