More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2402 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  44.75 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  40.83 
 
 		 241 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  44.9 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  41.04 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.08 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  46.81 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  44.5 
 
 		 259 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.84 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  46.74 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  43.88 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.41 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.5 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  42 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  39.41 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0785  HhH-GPD  37.62 
 
 		 269 aa  128  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.9 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  35.62 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.32 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  37.07 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  34.02 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  34.02 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1412  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  35.89 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.42 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  32.41 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  32.29 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 		 657 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.29 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  34.78 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  34.57 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.66 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  31.34 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  32.85 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  34.72 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  33.99 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.94 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.02 
 
 		 257 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  29.17 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  34.04 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.45 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.43 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  36.9 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.29 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  31.28 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  28.57 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  30.37 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  34.57 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  33.33 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  28.77 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.56 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  37.5 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  34.76 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  30 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  34.38 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  35.33 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  35.52 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  32.11 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  34.22 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  34.04 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  32.87 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.82 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  33.33 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35.14 
 
 		 208 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  33.33 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.33 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  34.78 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.96 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  33.33 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.61 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  36.96 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  33.18 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  32.46 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  34.24 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.51 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  30.23 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  29.77 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  34.24 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.41 
 
 		 178 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  31.9 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  30.23 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.11 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  32.11 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  34.24 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  32.57 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  34.74 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  30.7 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  32.57 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.02 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  29.36 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  33.16 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  33.16 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.79 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  32.57 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>