35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0969 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  96.26 
 
 		 881 aa  1770    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 		 883 aa  1835    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.76 
 
 		 835 aa  889    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.65 
 
 		 835 aa  889    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.81 
 
 		 854 aa  1041    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.03 
 
 		 753 aa  321  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1199  helicase-like  32.39 
 
 		 460 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00719413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1192  helicase domain-containing protein  33.05 
 
 		 456 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3060  helicase domain protein  29.24 
 
 		 460 aa  191  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.02 
 
 		 325 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.07 
 
 		 330 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  35.64 
 
 		 306 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.18 
 
 		 311 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2267  hypothetical protein  34.87 
 
 		 284 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.48 
 
 		 305 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  20.45 
 
 		 413 aa  49.3  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  30.07 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.58 
 
 		 222 aa  47.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  34.57 
 
 		 577 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.03 
 
 		 311 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.35 
 
 		 412 aa  46.6  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.37 
 
 		 292 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.64 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1021  SNF2 family helicase  22.07 
 
 		 631 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.49 
 
 		 849 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.53 
 
 		 283 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.37 
 
 		 446 aa  45.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.68 
 
 		 644 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.66 
 
 		 294 aa  44.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  39.66 
 
 		 294 aa  44.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  39.66 
 
 		 294 aa  44.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  39.66 
 
 		 294 aa  44.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  39.66 
 
 		 294 aa  44.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  39.66 
 
 		 294 aa  44.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  37.93 
 
 		 294 aa  44.3  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>