121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8236 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
311 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  56.39 
 
 
306 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.26 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.74 
 
 
753 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.85 
 
 
325 aa  215  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.18 
 
 
854 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.32 
 
 
835 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.32 
 
 
835 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.81 
 
 
881 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.18 
 
 
883 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.09 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  34.52 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.55 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.93 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  22.61 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.99 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.91 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.43 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.95 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.65 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.19 
 
 
396 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21 
 
 
293 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  40.26 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  32 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.4 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.71 
 
 
396 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.84 
 
 
368 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3032  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.37 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.14 
 
 
222 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  35.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  35.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  35.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  35.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  35.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.64 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.08 
 
 
429 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  33.75 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.75 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  33.75 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  33.75 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  33.75 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  38.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  38.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.77 
 
 
597 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.63 
 
 
292 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 
283 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  31.11 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  38.1 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  29.35 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  37.1 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  31.76 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.11 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.12 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  18.28 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  19.17 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  36.07 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  36.07 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.82 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.26 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.83 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.38 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.7 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.7 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  32.43 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.7 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  33.33 
 
 
577 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.15 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 
505 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.14 
 
 
398 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.85 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  32.43 
 
 
227 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  35 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  31.17 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  34.43 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  34.43 
 
 
391 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  32.43 
 
 
227 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  32.43 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  36.07 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  38.89 
 
 
378 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  19.19 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  39.29 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  39.29 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.51 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.64 
 
 
412 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.34 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  36.07 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.21 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.06 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>