39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1746 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 		 835 aa  1736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.42 
 
 		 881 aa  890    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.65 
 
 		 883 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.16 
 
 		 854 aa  914    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  97.6 
 
 		 835 aa  1698    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.18 
 
 		 753 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1199  helicase-like  32.66 
 
 		 460 aa  243  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00719413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1192  helicase domain-containing protein  33.88 
 
 		 456 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3060  helicase domain protein  31.59 
 
 		 460 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.95 
 
 		 325 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.16 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  34.38 
 
 		 306 aa  97.8  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.32 
 
 		 311 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2267  hypothetical protein  35.14 
 
 		 284 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  22.2 
 
 		 452 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  22.2 
 
 		 452 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  22.32 
 
 		 937 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  35.06 
 
 		 232 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  25.44 
 
 		 413 aa  51.2  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 877 aa  51.2  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  25.76 
 
 		 493 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.55 
 
 		 315 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.71 
 
 		 308 aa  49.3  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.71 
 
 		 308 aa  49.3  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.26 
 
 		 222 aa  48.9  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.21 
 
 		 311 aa  47.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  47.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.48 
 
 		 644 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 		 283 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  35.06 
 
 		 304 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  21.92 
 
 		 457 aa  46.2  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.89 
 
 		 255 aa  46.2  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  34.15 
 
 		 577 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.97 
 
 		 293 aa  45.8  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  35.8 
 
 		 329 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.05 
 
 		 334 aa  45.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.1 
 
 		 396 aa  44.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  28 
 
 		 1034 aa  44.3  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>