27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0341 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  59.63 
 
 		 854 aa  1054    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0341  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 		 881 aa  1831    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  96.26 
 
 		 883 aa  1770    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1684  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.54 
 
 		 835 aa  891    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1746  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.42 
 
 		 835 aa  890    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.663869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.21 
 
 		 753 aa  321  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1199  helicase-like  32.97 
 
 		 460 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00719413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1192  helicase domain-containing protein  31.89 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3060  helicase domain protein  28.51 
 
 		 460 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3059  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.3 
 
 		 325 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.35 
 
 		 330 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  36.17 
 
 		 306 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.81 
 
 		 311 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2267  hypothetical protein  34.21 
 
 		 284 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  20.67 
 
 		 413 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1021  SNF2 family helicase  21.52 
 
 		 631 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.48 
 
 		 305 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.12 
 
 		 292 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.84 
 
 		 849 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  30.07 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.81 
 
 		 446 aa  47.8  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.26 
 
 		 222 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.53 
 
 		 283 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.62 
 
 		 257 aa  47  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.35 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36 
 
 		 267 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.36 
 
 		 293 aa  45.8  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>