242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6611 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 
396 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  40.22 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.13 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.13 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 
222 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.84 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.13 
 
 
282 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.44 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  45.45 
 
 
225 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.63 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  44.93 
 
 
577 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  48.28 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.19 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.412238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  47.62 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.38 
 
 
243 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  50 
 
 
227 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.5 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  50 
 
 
227 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  38.46 
 
 
232 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  50 
 
 
227 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  50 
 
 
227 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  49.21 
 
 
243 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  49.21 
 
 
243 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.63 
 
 
286 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.15 
 
 
327 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
334 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  47.46 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  42.65 
 
 
567 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.69 
 
 
294 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  31.69 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.03 
 
 
553 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  59.18 
 
 
305 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.78 
 
 
315 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.39 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  45.9 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  36.21 
 
 
173 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  41.94 
 
 
271 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  38.1 
 
 
289 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  33.01 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  44.26 
 
 
304 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  41.18 
 
 
560 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  42.65 
 
 
566 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  44.44 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  30.99 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  35.06 
 
 
311 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.16 
 
 
253 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  61.7 
 
 
237 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  31.25 
 
 
309 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  46.3 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.06 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38 
 
 
253 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  46.67 
 
 
265 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  41.43 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  50 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  50 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  42.03 
 
 
283 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.19 
 
 
408 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.03 
 
 
283 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.04 
 
 
225 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.88 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.03 
 
 
283 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  42.03 
 
 
283 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.91 
 
 
271 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.55 
 
 
348 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  30.19 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.83 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  48.08 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  28.21 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.33 
 
 
225 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.6 
 
 
311 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  46.3 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0342  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.3 
 
 
581 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.1 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  36.36 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  29.91 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 
283 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 
283 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.32 
 
 
398 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8236  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.71 
 
 
311 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  42.86 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  44.44 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  44.44 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.3 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  37.14 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.33 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>