126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3423 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
374 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.412238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1171  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.5 
 
 
314 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4284  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.26 
 
 
314 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59615  normal  0.0736854 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.46 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.89 
 
 
282 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.19 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.67 
 
 
269 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.26 
 
 
238 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  25.87 
 
 
285 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.93 
 
 
225 aa  56.6  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  25.09 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  24.63 
 
 
236 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.99 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  39.76 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.91 
 
 
243 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.91 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.99 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.09 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  22.11 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.99 
 
 
286 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.48 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.26 
 
 
315 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  25.52 
 
 
367 aa  53.1  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.19 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  23.42 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  28.42 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.24 
 
 
223 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.77 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  23.05 
 
 
243 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.14 
 
 
225 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.55 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  40 
 
 
259 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  26.53 
 
 
372 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.68 
 
 
259 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.79 
 
 
225 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.53 
 
 
372 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  24.4 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  41.18 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  24.38 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.57 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.08 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  41.18 
 
 
283 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  24.36 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.03 
 
 
249 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.76 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.92 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  35.53 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  32.91 
 
 
270 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.26 
 
 
266 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.91 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.01 
 
 
265 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.91 
 
 
262 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.82 
 
 
398 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.07 
 
 
304 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.3 
 
 
283 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.79 
 
 
348 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  35.23 
 
 
352 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  35.23 
 
 
352 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  38.16 
 
 
348 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  36.05 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
276 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  39.13 
 
 
258 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.13 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.23 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.13 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.13 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  39.13 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  39.13 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  39.13 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.35 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.37 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.72 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.07 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.39 
 
 
412 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.06 
 
 
222 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.03 
 
 
301 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.38 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  37.37 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.56 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.53 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  35.82 
 
 
271 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  33.33 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  24.07 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  34.09 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.38 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.63 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  24.55 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1679  adenine-specific DNA methylase  28.74 
 
 
820 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.140302  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.14 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.67 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>