170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1171 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1171  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4284  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  79.62 
 
 
314 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59615  normal  0.0736854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.5 
 
 
374 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.412238 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.06 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  27.46 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.22 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.12 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.22 
 
 
283 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.22 
 
 
283 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  25.08 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.08 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.59 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  25.84 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.84 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.84 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  25.72 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.25 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.61 
 
 
359 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.57 
 
 
259 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.13 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  25.34 
 
 
266 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.91 
 
 
376 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  25.47 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.3 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  45.95 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  45.95 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.95 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.47 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.21 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  45.95 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  45.95 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.47 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.47 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  25.47 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  25.47 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  25.47 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  45.95 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  45.95 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  36.84 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  44.59 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  44.59 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.53 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  25.46 
 
 
379 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.61 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  45.59 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  23.78 
 
 
367 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  45.59 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  24.07 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  45.59 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  45.59 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  45.59 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2243  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.16 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000134525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.47 
 
 
273 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.29 
 
 
380 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  37.21 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.43 
 
 
382 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.57 
 
 
377 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.15 
 
 
395 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.65 
 
 
225 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.93 
 
 
367 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  43.08 
 
 
215 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.37 
 
 
225 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.16 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.27 
 
 
226 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.57 
 
 
358 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  22.18 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  24.18 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.27 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  24.28 
 
 
378 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.31 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  35.62 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.82 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.49 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  42.86 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  23.88 
 
 
377 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.11 
 
 
158 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  23.88 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.4 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.59 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  39.47 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.88 
 
 
398 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.01 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  40.62 
 
 
283 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  43.28 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.21 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  41.43 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  43.94 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  43.28 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.25 
 
 
419 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 
483 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  37.5 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.42 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.28 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.91 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  43.28 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  41.18 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.91 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>