245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0066 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0066  DNA methylase  100 
 
 		 411 aa  853    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  79.06 
 
 		 413 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  76.83 
 
 		 412 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  78.33 
 
 		 413 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  69.95 
 
 		 408 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  65.27 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  47.8 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  48.68 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  39.65 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  41.53 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  40.1 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  39.55 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.69 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  38.21 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  37.56 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.86 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  29.83 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  31.06 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  31.06 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  31.06 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  30.82 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  30.82 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.48 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  29.41 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  37.5 
 
 		 684 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  30.88 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  30.64 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.84 
 
 		 483 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  29.57 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  28.64 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  53.38 
 
 		 223 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.83 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.5 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  28.5 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  26.77 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  37.07 
 
 		 222 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.4 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  31.13 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.34 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.31 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  26.61 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  27.47 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  27.04 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  25.97 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  26.1 
 
 		 227 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  27.07 
 
 		 203 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  34.07 
 
 		 169 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.64 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  31 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  27.91 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.23 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  25.1 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.35 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.98 
 
 		 225 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  33.09 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  30.66 
 
 		 183 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  31.03 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  26.63 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.48 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.32 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.7 
 
 		 284 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.65 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  26.83 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  25.93 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.12 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.37 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.67 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  23.66 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  34.62 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  25.61 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.66 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.12 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1954  DNA methylase  23.53 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000695995  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.47 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.98 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.45 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.89 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  26.09 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.4 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.91 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  25.75 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.99 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.72 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.36 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0831  nuclease  32.82 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.68 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  25.55 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.34 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.26 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  25.32 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.55 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06031  hypothetical protein  39.06 
 
 		 82 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  25.32 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  25.32 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  25.32 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.98 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  25.32 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  22.55 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>