138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2905 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  98.65 
 
 		 444 aa  905    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  80.64 
 
 		 452 aa  746    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  80.18 
 
 		 448 aa  743    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  80.64 
 
 		 452 aa  746    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  80.87 
 
 		 452 aa  746    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  80.18 
 
 		 448 aa  743    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  100 
 
 		 444 aa  914    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  65.67 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.69 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  42.82 
 
 		 421 aa  306  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  38.71 
 
 		 421 aa  292  9e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  41.45 
 
 		 411 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.8 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.27 
 
 		 464 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  35.55 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  35.78 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32.72 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  33.41 
 
 		 408 aa  220  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  36.36 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  38.29 
 
 		 684 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  31.23 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  31.96 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  33.04 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.01 
 
 		 412 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.92 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.54 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  51.26 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  31.12 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.4 
 
 		 471 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.98 
 
 		 483 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  31.52 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  52.85 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  66.41 
 
 		 247 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.5 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  50.54 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  27.33 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  50.75 
 
 		 203 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  53.33 
 
 		 183 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  51.43 
 
 		 178 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  49.35 
 
 		 196 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  49.66 
 
 		 200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  47.69 
 
 		 169 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.86 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  52.29 
 
 		 177 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  42.75 
 
 		 184 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  44.03 
 
 		 212 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  45.8 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  33 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  43.65 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  53.49 
 
 		 87 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  55.13 
 
 		 131 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  55.84 
 
 		 77 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  37.5 
 
 		 196 aa  86.7  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  37.59 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.74 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.74 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.18 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.46 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  34.88 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  23.9 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  29.77 
 
 		 223 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.6 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  27.15 
 
 		 304 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.83 
 
 		 226 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.18 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  29.67 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  37.84 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.08 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  36.59 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  28.04 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.11 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.6 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  31.18 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.11 
 
 		 286 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.66 
 
 		 273 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  28.57 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.29 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  28.57 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.71 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.71 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  38.89 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  24.34 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1200  DNA methylase N-4/N-6  29.59 
 
 		 306 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00320922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 352 aa  46.6  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.95 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  28.95 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  28.95 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.95 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.95 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  33.7 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  28.95 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.71 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.79 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.95 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.88 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  24.47 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>