232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2654 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  100 
 
 		 447 aa  914    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  76.59 
 
 		 441 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  82.14 
 
 		 471 aa  745    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  66.42 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  35.63 
 
 		 448 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  35.63 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  35.63 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  35.41 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  35.41 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  63.44 
 
 		 222 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.62 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  35.26 
 
 		 463 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  34.58 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  34.82 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  55.38 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.85 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.15 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  54.05 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.41 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.75 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  43.72 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  52.43 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  50.81 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.26 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  52.91 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  31.6 
 
 		 470 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  42.41 
 
 		 684 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  28 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  60 
 
 		 183 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  53.15 
 
 		 196 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.91 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  53.04 
 
 		 203 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  37.56 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  35.91 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  54.72 
 
 		 247 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  31.13 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  54.05 
 
 		 200 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  49.55 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.08 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.58 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  28.51 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  33.88 
 
 		 417 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  49.06 
 
 		 177 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  45.45 
 
 		 212 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  46.55 
 
 		 178 aa  99.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.78 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  40.77 
 
 		 184 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.36 
 
 		 293 aa  96.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.69 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  43.51 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.42 
 
 		 292 aa  90.9  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.56 
 
 		 274 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.79 
 
 		 597 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.34 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.27 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.1 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  40.91 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.88 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.5 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  39.81 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  24.67 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  51.61 
 
 		 87 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  24.26 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.49 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.12 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.89 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.9 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.37 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.36 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.86 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.18 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.84 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  53.7 
 
 		 131 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.81 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.08 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  52.83 
 
 		 77 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.59 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.59 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.62 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.76 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.12 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.79 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.79 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.88 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.28 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  26.26 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  21.13 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  30.27 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.32 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.88 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  40.62 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.23 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.95 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  49.02 
 
 		 94 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  49.02 
 
 		 94 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.79 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 		 222 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.32 
 
 		 313 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>