67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4927 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4927  nuclease  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  43.5 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  50.75 
 
 		 444 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  50 
 
 		 444 aa  148  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  46.72 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  55.2 
 
 		 471 aa  140  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  41.57 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  47.58 
 
 		 421 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  47.01 
 
 		 452 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  47.01 
 
 		 452 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  44.65 
 
 		 459 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  49.22 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  46.27 
 
 		 448 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  46.27 
 
 		 452 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  46.27 
 
 		 448 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  46.43 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  49.64 
 
 		 421 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  50.4 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.32 
 
 		 425 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  46.34 
 
 		 463 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  47.73 
 
 		 411 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.35 
 
 		 464 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  44.93 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  45.86 
 
 		 435 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  42.96 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  52.38 
 
 		 441 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  46.03 
 
 		 436 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.44 
 
 		 421 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  53.04 
 
 		 447 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  39.2 
 
 		 470 aa  104  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  33.9 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  52.33 
 
 		 87 aa  101  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  39.33 
 
 		 459 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  37.9 
 
 		 684 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  35.71 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  42.62 
 
 		 396 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  53.25 
 
 		 131 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  53.25 
 
 		 77 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  35.2 
 
 		 408 aa  92  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.2 
 
 		 409 aa  92  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.59 
 
 		 488 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  39.67 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  40.3 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  32.56 
 
 		 410 aa  77.8  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.56 
 
 		 403 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.6 
 
 		 483 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  27.07 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  32.41 
 
 		 411 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.61 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.52 
 
 		 412 aa  58.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  27.34 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  24.24 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.24 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.67 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.67 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  28.81 
 
 		 417 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  27.54 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  38.6 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  35.34 
 
 		 297 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.14 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  36.17 
 
 		 352 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.95 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  30.91 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.7 
 
 		 281 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  34.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 367 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  26.57 
 
 		 284 aa  41.2  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>