221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0653 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  100 
 
 		 459 aa  931    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.37 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  47.56 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  45.95 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  42.66 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.37 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  39.65 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  40.18 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.82 
 
 		 408 aa  305  8.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.72 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.31 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  37.79 
 
 		 411 aa  299  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  36.34 
 
 		 408 aa  280  5e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  39.42 
 
 		 435 aa  276  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.37 
 
 		 409 aa  274  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  38.38 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  35.23 
 
 		 417 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  36.28 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  36.54 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  32.78 
 
 		 448 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  32.78 
 
 		 448 aa  232  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  32.84 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  32.62 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  32.62 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.95 
 
 		 488 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  34.75 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  34.98 
 
 		 444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  34.16 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.58 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  49.25 
 
 		 222 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.88 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  32.96 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  34.68 
 
 		 684 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.27 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  58.52 
 
 		 183 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  55.78 
 
 		 200 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  61.29 
 
 		 247 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  27.87 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  44.65 
 
 		 203 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  51.59 
 
 		 169 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  52.67 
 
 		 178 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  42.48 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  46.58 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  59.79 
 
 		 177 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  46.04 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  44.72 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  37.96 
 
 		 196 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  55.84 
 
 		 87 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  57.14 
 
 		 131 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  58.21 
 
 		 77 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  38.28 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.09 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  35.71 
 
 		 222 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.28 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.5 
 
 		 94 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.5 
 
 		 94 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.14 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.52 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  27.17 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  26.44 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  24.11 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06031  hypothetical protein  42.03 
 
 		 82 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  25.75 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  23.87 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.91 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  25.3 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.26 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  32.31 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  24.68 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  23.04 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  24.21 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  25.4 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.93 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.21 
 
 		 222 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.05 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  26.56 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.18 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  23.62 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  25.22 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.19 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.58 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.73 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.396214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.71 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.65 
 
 		 223 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  20.49 
 
 		 283 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  23.69 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.82 
 
 		 322 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.94 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  23.81 
 
 		 389 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.14 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.48 
 
 		 289 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.8 
 
 		 311 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.05 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.48 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.05 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>