251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2842 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0066  DNA methylase  78.33 
 
 		 411 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  97.34 
 
 		 413 aa  833    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  85.57 
 
 		 412 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 413 aa  853    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  69.7 
 
 		 411 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  68.72 
 
 		 408 aa  590  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  51.33 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  47.79 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  42.99 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  39.72 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  40.91 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.16 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  39.9 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  39.15 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  37.89 
 
 		 408 aa  255  8e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.04 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  31.37 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.9 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  31.02 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  31.03 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  30.79 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  30.56 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  30.56 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  31.48 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  30.37 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  31.46 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.81 
 
 		 483 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  34.72 
 
 		 684 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.44 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  29.27 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  29.38 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  28.88 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  29.9 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  50.38 
 
 		 223 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  37.07 
 
 		 222 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.06 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.53 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  29.58 
 
 		 447 aa  99.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.49 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  26.51 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.62 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  27.95 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  27.31 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  27.31 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  27.75 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.32 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.11 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  28.34 
 
 		 225 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.68 
 
 		 258 aa  67  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 		 226 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  26.36 
 
 		 264 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1954  DNA methylase  23.81 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000695995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  23.01 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.54 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  25.21 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.51 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.55 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  33.33 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  25.61 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  25.22 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  24.89 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.19 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.21 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0831  nuclease  32.52 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  26.42 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.18 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  22.76 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  22.76 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  22.76 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  22.76 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  22.76 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  24.79 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  24.03 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  24.79 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  29.19 
 
 		 200 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.07 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.47 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.11 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.94 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  28.28 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.11 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.08 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  31.19 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  29.47 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06031  hypothetical protein  40.62 
 
 		 82 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  25.79 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  25.41 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.28 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.18 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.22 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.67 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.23 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.58 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  25.45 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.18 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  22.88 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.74 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>