89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3667 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3667  DNA methylase  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  98.55 
 
 		 200 aa  274  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  84.73 
 
 		 258 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  66.94 
 
 		 249 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  66.13 
 
 		 249 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  48.46 
 
 		 236 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  39.01 
 
 		 265 aa  87.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.06 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.8 
 
 		 238 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.46 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  39.69 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  39.39 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  39.39 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.56 
 
 		 265 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  33.58 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.96 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.71 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1911  putative DNA-methyltransferase protein  48.48 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  31.25 
 
 		 266 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  40.91 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.67 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.28 
 
 		 327 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  44.62 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  44.62 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  32.67 
 
 		 377 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  32.67 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.49 
 
 		 359 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.33 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.79 
 
 		 301 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  41.54 
 
 		 311 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.62 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 305 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  43.55 
 
 		 301 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  39.44 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 		 379 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.88 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.53 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  31.33 
 
 		 377 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.86 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.14 
 
 		 369 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.11 
 
 		 305 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.88 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  42.86 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.03 
 
 		 369 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.42 
 
 		 379 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  30 
 
 		 372 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  39.06 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  32.74 
 
 		 380 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.42 
 
 		 380 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  42.86 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  45.45 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.31 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  42.86 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  42.86 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  27.88 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  24.49 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  36.36 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  42.86 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  42.86 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.22 
 
 		 370 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.45 
 
 		 389 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  42.86 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  42.86 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 		 323 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.53 
 
 		 370 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  27.72 
 
 		 227 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1171  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 314 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237627 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  26.98 
 
 		 227 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  25.85 
 
 		 367 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.82 
 
 		 382 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.88 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  28.71 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  32.05 
 
 		 227 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.88 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  25.6 
 
 		 230 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.67 
 
 		 376 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  26.43 
 
 		 377 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.56 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.23 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.16 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25 
 
 		 367 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>