69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3720 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3720  DNA modification methylase-like protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  61.39 
 
 		 261 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  60.4 
 
 		 227 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  59.41 
 
 		 227 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  57.43 
 
 		 225 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  59.41 
 
 		 227 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  57.43 
 
 		 227 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  58.42 
 
 		 327 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  56.12 
 
 		 215 aa  129  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.02 
 
 		 225 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  55.1 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 225 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.63 
 
 		 223 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 		 226 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.62 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  35 
 
 		 411 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.84 
 
 		 382 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.99 
 
 		 412 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.33 
 
 		 258 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.84 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.96 
 
 		 413 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  35.56 
 
 		 459 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.85 
 
 		 597 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  31.96 
 
 		 413 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  27.27 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.92 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.36 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.67 
 
 		 293 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  32.65 
 
 		 411 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.78 
 
 		 352 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  30.25 
 
 		 373 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  30.3 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.31 
 
 		 276 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.36 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  28.28 
 
 		 348 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  28.28 
 
 		 349 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.02 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  28.28 
 
 		 352 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.13 
 
 		 299 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  27.27 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  35.85 
 
 		 377 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.53 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  27.27 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  27.27 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.73 
 
 		 308 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.92 
 
 		 376 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 		 379 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  27.27 
 
 		 352 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  27.27 
 
 		 352 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.08 
 
 		 369 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  26.92 
 
 		 377 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.19 
 
 		 369 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  28.42 
 
 		 391 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.3 
 
 		 396 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  30 
 
 		 421 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1065  modification methylase CcrMI (adenine-specificmethyltransferase CcrMI) (M.CcrMI)  51.85 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.694952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.02 
 
 		 375 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35 
 
 		 292 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.53 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  26.92 
 
 		 377 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.85 
 
 		 370 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>