177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0682 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0682  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 		 230 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  61.68 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  59.07 
 
 		 218 aa  274  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  59.07 
 
 		 220 aa  271  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  55.98 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0419  DNA methylase N-4/N-6  28.7 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  32.14 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.37 
 
 		 464 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.82 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.94 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.21 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  25.93 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.59 
 
 		 359 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  26.89 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.39 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  27.85 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  28.3 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  28.3 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  27.67 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  24.11 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  23.79 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.42 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  27.36 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.81 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.6 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.42 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  25.22 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.59 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5892  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.37 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  24.7 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.84 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  27.09 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.09 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.02 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.93 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.94 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.49 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.38 
 
 		 419 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  28.12 
 
 		 413 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  39.13 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  23.4 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  24.49 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.13 
 
 		 327 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.51 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.99 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.32 
 
 		 358 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.93 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.07 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.69 
 
 		 379 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  28.19 
 
 		 417 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.56 
 
 		 413 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.91 
 
 		 348 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.66 
 
 		 370 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.15 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.34 
 
 		 733 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.99 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  25.31 
 
 		 378 aa  51.6  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.19 
 
 		 276 aa  51.6  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  25.1 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  25.1 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  30.08 
 
 		 435 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  25.68 
 
 		 377 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.61 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.89 
 
 		 373 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  25.1 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  25.1 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  25.1 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  25.13 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  43.86 
 
 		 646 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.6 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  25.1 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.67 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.28 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.17 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  40.62 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  40.62 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.62 
 
 		 380 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  25.39 
 
 		 421 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  29.63 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.66 
 
 		 334 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  39.39 
 
 		 599 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  24.32 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.64 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.32 
 
 		 408 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.39 
 
 		 599 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.24 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  24.69 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.73 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3821  DNA modification methylase-like protein  46.15 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.62 
 
 		 545 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  24.69 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.26 
 
 		 421 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  39.06 
 
 		 352 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  39.06 
 
 		 352 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  22.76 
 
 		 289 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  24.05 
 
 		 377 aa  48.5  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  24.05 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.62 
 
 		 644 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  40.62 
 
 		 349 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>