83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01340 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  274  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  97.53 
 
 		 87 aa  164  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  61.54 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01352  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  59.74 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  53.49 
 
 		 196 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  51.14 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  53.25 
 
 		 203 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  55.13 
 
 		 444 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  53.85 
 
 		 444 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  57.14 
 
 		 459 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  56.58 
 
 		 463 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  57.53 
 
 		 222 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  58.11 
 
 		 247 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  54.67 
 
 		 435 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  56.94 
 
 		 421 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.7 
 
 		 471 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  55.56 
 
 		 411 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  53.33 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  56.94 
 
 		 425 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  40 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.62 
 
 		 464 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  50.65 
 
 		 448 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  50.65 
 
 		 452 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  50.65 
 
 		 452 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  50.65 
 
 		 448 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  50.65 
 
 		 452 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 421 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  47.37 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  49.23 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2192  hypothetical protein  65.91 
 
 		 370 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  43.84 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  53.23 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  42.86 
 
 		 410 aa  67.8  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  42.11 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  46.97 
 
 		 459 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  55.17 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  57.14 
 
 		 441 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  53.7 
 
 		 447 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  39.13 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.5 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  39.19 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.5 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  40.91 
 
 		 684 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  40 
 
 		 286 aa  52.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  34.72 
 
 		 408 aa  51.2  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 369 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506373 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32.35 
 
 		 409 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.57 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  46.81 
 
 		 282 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  37.14 
 
 		 401 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  34.29 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  28.21 
 
 		 483 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  27.03 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  25.29 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  31.76 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  39.19 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 269 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2792  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  41.46 
 
 		 362 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.805909  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.29 
 
 		 293 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  38.75 
 
 		 292 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  30.36 
 
 		 328 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  36.25 
 
 		 281 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  36.11 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  39.19 
 
 		 313 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  26.67 
 
 		 283 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40.28 
 
 		 281 aa  41.2  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  34.72 
 
 		 283 aa  41.2  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3558  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  37.29 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  40.74 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  36.84 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  36.11 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  38.03 
 
 		 310 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  37.5 
 
 		 294 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3378  SPP1 family phage head morphogenesis protein  41.86 
 
 		 348 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  33.33 
 
 		 447 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  36.21 
 
 		 312 aa  40  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 284 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  40.68 
 
 		 297 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>