56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6266 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  64.38 
 
 		 184 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.63 
 
 		 471 aa  128  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  43.2 
 
 		 222 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  47.79 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  44.37 
 
 		 448 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  44.37 
 
 		 448 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  44.37 
 
 		 452 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  44.37 
 
 		 452 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  44.37 
 
 		 452 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  46.9 
 
 		 463 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  46.04 
 
 		 459 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  46.38 
 
 		 459 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  47.33 
 
 		 435 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  44.03 
 
 		 444 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  44.03 
 
 		 444 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  46.04 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  41.72 
 
 		 421 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.84 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  40.44 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  43.57 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  43.26 
 
 		 411 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  42.14 
 
 		 421 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.8 
 
 		 425 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  35.71 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  42.45 
 
 		 247 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  46.49 
 
 		 441 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  39.58 
 
 		 436 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  45.3 
 
 		 177 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  38.28 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.54 
 
 		 421 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  45.45 
 
 		 447 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  36.77 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  34.31 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.5 
 
 		 488 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  35.11 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  34.78 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  34.29 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32.61 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  41.3 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  55.17 
 
 		 77 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  55.17 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  32.43 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  28.14 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  30.28 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.66 
 
 		 412 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.86 
 
 		 408 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  27.41 
 
 		 413 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.62 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  42.62 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  27.54 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.74 
 
 		 413 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.16 
 
 		 483 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.23 
 
 		 432 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2626  hypothetical protein  28.02 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0898981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>