99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0830 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
196 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  47.11 
 
 
684 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  43.44 
 
 
408 aa  106  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  43.55 
 
 
409 aa  104  7e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  36.55 
 
 
183 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  37.01 
 
 
169 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  37.96 
 
 
459 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.62 
 
 
471 aa  99  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  36.49 
 
 
463 aa  95.5  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  33.08 
 
 
435 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  33.76 
 
 
448 aa  95.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  33.76 
 
 
452 aa  94.7  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  33.76 
 
 
452 aa  94.7  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  42.03 
 
 
222 aa  94.4  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  33.76 
 
 
448 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  33.76 
 
 
452 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.17 
 
 
421 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  38.28 
 
 
247 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  31.69 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  39.67 
 
 
203 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  36.97 
 
 
222 aa  88.2  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  39.84 
 
 
178 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  39.29 
 
 
421 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  39.47 
 
 
444 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  39.47 
 
 
444 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.58 
 
 
464 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  36.64 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.18 
 
 
425 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  36.21 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  53.62 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  53.62 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  36.97 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  36.29 
 
 
436 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  37.5 
 
 
177 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.15 
 
 
488 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  41 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  41.25 
 
 
87 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  35.11 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  42.67 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  43.84 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  33.87 
 
 
410 aa  67  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  33.55 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  32.86 
 
 
396 aa  67  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  35.92 
 
 
447 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  32.76 
 
 
470 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  27.95 
 
 
459 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.77 
 
 
483 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  31.62 
 
 
411 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.21 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.37 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  37.21 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.21 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  34.88 
 
 
256 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  34.48 
 
 
283 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  34.88 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  34.88 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  34.88 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  34.48 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  34.88 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  28.8 
 
 
411 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.89 
 
 
408 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  32.93 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  32.47 
 
 
358 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  36.62 
 
 
272 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  31.17 
 
 
355 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1535  ParB domain protein nuclease  34.25 
 
 
424 aa  45.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  34.88 
 
 
278 aa  45.1  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
321 aa  45.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  36.05 
 
 
283 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  34.88 
 
 
278 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  34.88 
 
 
278 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  35.14 
 
 
300 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  28.57 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.59 
 
 
413 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  35.11 
 
 
477 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  34.21 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  30.77 
 
 
352 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  33.33 
 
 
281 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  28.57 
 
 
292 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  28.57 
 
 
292 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  28.57 
 
 
292 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  36.59 
 
 
290 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  38.57 
 
 
292 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  36.59 
 
 
290 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  29.87 
 
 
282 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  28.57 
 
 
292 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  35.37 
 
 
290 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  28.57 
 
 
292 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  31.94 
 
 
300 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  28.57 
 
 
292 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  28.57 
 
 
292 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  35 
 
 
292 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  29.46 
 
 
268 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  38.57 
 
 
289 aa  41.2  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  32.39 
 
 
279 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  32.86 
 
 
293 aa  41.2  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.99 
 
 
269 aa  41.2  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  27.95 
 
 
292 aa  41.2  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  32.39 
 
 
293 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>