82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2279 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  97.53 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  160  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  60.24 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  55.29 
 
 		 183 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  57.32 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  52.94 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  52.33 
 
 		 203 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  55.42 
 
 		 463 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  53.49 
 
 		 444 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  55.84 
 
 		 459 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  52.33 
 
 		 444 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  56.1 
 
 		 247 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  54.32 
 
 		 222 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  54.32 
 
 		 421 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  52.5 
 
 		 435 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.22 
 
 		 471 aa  90.5  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  51.85 
 
 		 411 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.09 
 
 		 425 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  50 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  48.84 
 
 		 448 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  48.84 
 
 		 452 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  48.84 
 
 		 448 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  48.84 
 
 		 452 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  48.84 
 
 		 452 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.95 
 
 		 464 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  48.61 
 
 		 436 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  49.33 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.15 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  47.37 
 
 		 421 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  43.02 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  40.62 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  41.25 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  40.48 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  51.61 
 
 		 447 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  38.54 
 
 		 459 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  52.63 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  41.3 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  39.76 
 
 		 396 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  36.36 
 
 		 470 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  36.49 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  36.49 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  40.54 
 
 		 684 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.84 
 
 		 488 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  39.74 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  32.93 
 
 		 408 aa  54.3  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  30.77 
 
 		 409 aa  52  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.57 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  34.83 
 
 		 280 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  36.23 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  37.5 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  34.29 
 
 		 297 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  37.14 
 
 		 401 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  46.81 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  34.92 
 
 		 312 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  34.94 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  39.19 
 
 		 311 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  29.33 
 
 		 328 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.29 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  33.75 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  30.14 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.16 
 
 		 483 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  36.11 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  39.19 
 
 		 313 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  36.11 
 
 		 293 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  36.25 
 
 		 281 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  34.85 
 
 		 295 aa  41.2  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40.28 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  36.11 
 
 		 293 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  38.03 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  37.84 
 
 		 605 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  37.5 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  38.03 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  38.81 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  37.33 
 
 		 303 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  36.49 
 
 		 311 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  31.43 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  31.94 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 283 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.43 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>