More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3268 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  100 
 
 
565 aa  1128    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  50.98 
 
 
572 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  42.42 
 
 
668 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1601  parB-like partition protein  29.57 
 
 
864 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  36.65 
 
 
597 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  36.11 
 
 
605 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  41.71 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40 
 
 
274 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.39 
 
 
292 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  45.45 
 
 
293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  41.48 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  37.5 
 
 
272 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40.23 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  41.82 
 
 
298 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  42.6 
 
 
293 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  42.01 
 
 
281 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  42.42 
 
 
294 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  34.31 
 
 
286 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  43.03 
 
 
296 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  39.29 
 
 
303 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  40.65 
 
 
298 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  48.3 
 
 
296 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.61 
 
 
282 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  37.57 
 
 
293 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  43.03 
 
 
296 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.61 
 
 
299 aa  108  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.37 
 
 
279 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.94 
 
 
298 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.94 
 
 
298 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.94 
 
 
298 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.97 
 
 
269 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.88 
 
 
314 aa  107  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.56 
 
 
298 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  33.17 
 
 
268 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  35.45 
 
 
293 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  35.45 
 
 
293 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.51 
 
 
301 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  40.65 
 
 
288 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40.65 
 
 
290 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  36.81 
 
 
293 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  35.83 
 
 
283 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  37.27 
 
 
303 aa  105  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.1 
 
 
272 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  37.1 
 
 
323 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  35.83 
 
 
283 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  35.29 
 
 
283 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
283 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  36.26 
 
 
256 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  35.29 
 
 
283 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.5 
 
 
278 aa  103  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.5 
 
 
278 aa  103  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.37 
 
 
289 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  35.45 
 
 
283 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  38.71 
 
 
256 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  35.18 
 
 
285 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  35.62 
 
 
289 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  34.22 
 
 
283 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  43.06 
 
 
295 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  34.22 
 
 
283 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42.55 
 
 
279 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  43.26 
 
 
278 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  37.99 
 
 
286 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  43.29 
 
 
305 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  35 
 
 
280 aa  101  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.55 
 
 
279 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  38.73 
 
 
286 aa  100  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  32.21 
 
 
583 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  40.74 
 
 
294 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  36.91 
 
 
283 aa  100  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  42.07 
 
 
295 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  34.22 
 
 
283 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.36 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  36.88 
 
 
281 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.36 
 
 
297 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.36 
 
 
297 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.36 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  37.43 
 
 
290 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  37.43 
 
 
290 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  40.69 
 
 
295 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  37.72 
 
 
301 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.01 
 
 
294 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  37.36 
 
 
297 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  35.53 
 
 
281 aa  99  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  36.3 
 
 
268 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  36.08 
 
 
257 aa  98.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  38.04 
 
 
296 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  38.89 
 
 
299 aa  98.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  34.66 
 
 
281 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  33.69 
 
 
286 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  33.69 
 
 
286 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  39.1 
 
 
310 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  37.7 
 
 
294 aa  97.8  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  39.02 
 
 
294 aa  97.8  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  39.02 
 
 
294 aa  97.8  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>