More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1601 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1601  parB-like partition protein  100 
 
 
864 aa  1744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  40.1 
 
 
668 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  34.04 
 
 
605 aa  178  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  33.43 
 
 
565 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  33.44 
 
 
597 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  30 
 
 
572 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  43.3 
 
 
305 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  39.79 
 
 
305 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  34.6 
 
 
286 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.25 
 
 
294 aa  130  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40 
 
 
310 aa  129  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  37.44 
 
 
304 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  36.27 
 
 
301 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  38.33 
 
 
303 aa  127  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  41.85 
 
 
281 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.22 
 
 
274 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  35.71 
 
 
281 aa  125  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.66 
 
 
294 aa  126  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  37.99 
 
 
292 aa  125  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  33.68 
 
 
299 aa  124  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  36.02 
 
 
287 aa  124  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  37.88 
 
 
304 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 
283 aa  124  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  34.72 
 
 
326 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  38.62 
 
 
300 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  35.98 
 
 
292 aa  123  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  39.43 
 
 
298 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  38.46 
 
 
286 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  34.9 
 
 
298 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  37.99 
 
 
293 aa  121  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  35.94 
 
 
293 aa  121  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  34.85 
 
 
281 aa  121  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  36.11 
 
 
293 aa  120  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  36.11 
 
 
293 aa  120  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  36.31 
 
 
296 aa  120  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  35.42 
 
 
296 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  38.12 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  38.2 
 
 
297 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  35.42 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  35.48 
 
 
295 aa  119  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  36.51 
 
 
305 aa  119  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  36.26 
 
 
293 aa  119  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  34.76 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  34.9 
 
 
293 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  33.19 
 
 
278 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  33.19 
 
 
278 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  35.44 
 
 
294 aa  118  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  34.9 
 
 
296 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  35.39 
 
 
286 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  35.05 
 
 
289 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  34.33 
 
 
283 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  37.08 
 
 
306 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  36.52 
 
 
296 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  38.55 
 
 
296 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.96 
 
 
301 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  34.33 
 
 
283 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  39.36 
 
 
331 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  34.33 
 
 
283 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  34.91 
 
 
323 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  33.83 
 
 
283 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  115  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  31.02 
 
 
263 aa  115  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  33.33 
 
 
294 aa  115  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  34.08 
 
 
303 aa  114  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  36.45 
 
 
307 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  36.87 
 
 
288 aa  114  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  38.07 
 
 
268 aa  114  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  33.51 
 
 
283 aa  114  9e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  34.47 
 
 
289 aa  114  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  35.45 
 
 
282 aa  113  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  34.18 
 
 
295 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  35.75 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
289 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  32.71 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 
283 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  31.58 
 
 
289 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  38.46 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  34.52 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.51 
 
 
304 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  33.5 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  37.91 
 
 
294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  32.84 
 
 
283 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  35.48 
 
 
283 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  38.02 
 
 
284 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  33.33 
 
 
293 aa  112  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  34.54 
 
 
286 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  38.83 
 
 
331 aa  112  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  35.48 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  31.49 
 
 
294 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  31.49 
 
 
294 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  35 
 
 
302 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  33.33 
 
 
282 aa  111  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  34.9 
 
 
298 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  34.44 
 
 
314 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  37.76 
 
 
306 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  35.87 
 
 
295 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  33.17 
 
 
281 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 
283 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>