More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1123 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  100 
 
 
572 aa  1142    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  48.87 
 
 
565 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  36.73 
 
 
668 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  36.04 
 
 
597 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1601  parB-like partition protein  30 
 
 
864 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  31.79 
 
 
605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  39.06 
 
 
293 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  38.54 
 
 
294 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  43.84 
 
 
288 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  43.84 
 
 
290 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.65 
 
 
314 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  43.07 
 
 
303 aa  104  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  35.62 
 
 
303 aa  103  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  35.79 
 
 
293 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  35.79 
 
 
293 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  39.35 
 
 
293 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  36.56 
 
 
326 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  38.6 
 
 
293 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  36.54 
 
 
268 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  40.54 
 
 
306 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.25 
 
 
298 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  38.12 
 
 
274 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.25 
 
 
298 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  39.86 
 
 
296 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  40.25 
 
 
362 aa  100  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  36.09 
 
 
298 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.35 
 
 
323 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  39.62 
 
 
297 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  38.75 
 
 
296 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  39.62 
 
 
297 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  39.62 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  40.62 
 
 
298 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  39.62 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  37.93 
 
 
290 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  37.5 
 
 
296 aa  99.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  39.62 
 
 
295 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  34.48 
 
 
287 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  37.64 
 
 
299 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  35.8 
 
 
272 aa  98.6  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  35.5 
 
 
313 aa  97.8  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  36.31 
 
 
295 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  38.99 
 
 
295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  37.36 
 
 
290 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  37.74 
 
 
288 aa  97.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  37.36 
 
 
290 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  36.78 
 
 
290 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  37.5 
 
 
296 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  38.27 
 
 
303 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  41.67 
 
 
297 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  37.93 
 
 
290 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.28 
 
 
278 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.28 
 
 
278 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  40.26 
 
 
294 aa  96.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  39.02 
 
 
294 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.97 
 
 
300 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
289 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  42.86 
 
 
291 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40.29 
 
 
293 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  39.02 
 
 
294 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  37.42 
 
 
290 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  36.84 
 
 
296 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  40 
 
 
298 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.04 
 
 
256 aa  95.1  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.35 
 
 
319 aa  95.1  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  37.36 
 
 
290 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  39.57 
 
 
293 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  33.51 
 
 
286 aa  94.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.71 
 
 
304 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  38.16 
 
 
299 aa  94.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  37.01 
 
 
297 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  37.42 
 
 
290 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  36.97 
 
 
315 aa  94.4  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  39.71 
 
 
285 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  38.82 
 
 
312 aa  94  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  38.16 
 
 
279 aa  93.6  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  38.57 
 
 
290 aa  93.6  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.94 
 
 
269 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  37.11 
 
 
301 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  37.11 
 
 
296 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  38.62 
 
 
295 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  41.48 
 
 
281 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  39.31 
 
 
310 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  32.92 
 
 
302 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  37.58 
 
 
294 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  38.06 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  40.62 
 
 
392 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
306 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  33.97 
 
 
298 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  38.51 
 
 
321 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  39.23 
 
 
281 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  31.58 
 
 
268 aa  91.3  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  33.12 
 
 
281 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  38.13 
 
 
300 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  38.13 
 
 
298 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0917667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>