More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2513 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  98.86 
 
 
263 aa  535  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  44.92 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  45.49 
 
 
290 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  45.53 
 
 
290 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  44.09 
 
 
283 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  45.53 
 
 
288 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  45.45 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  45.1 
 
 
290 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  45.1 
 
 
290 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  45.67 
 
 
304 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  44.88 
 
 
295 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  45.28 
 
 
290 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  43.43 
 
 
289 aa  214  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  45.02 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.8 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  45.67 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  45.67 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  45.67 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  45.28 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  45.88 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  45.49 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  45.82 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  44.49 
 
 
295 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  43.78 
 
 
294 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  43.19 
 
 
292 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  44.62 
 
 
309 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  44.11 
 
 
303 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  44.62 
 
 
303 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  45.63 
 
 
290 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  41.34 
 
 
294 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  42.69 
 
 
294 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  44.19 
 
 
294 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  41.86 
 
 
296 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  42.8 
 
 
292 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  42.8 
 
 
292 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  42.8 
 
 
292 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  42.8 
 
 
292 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  42.02 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  44.62 
 
 
286 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  44.57 
 
 
307 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  44.84 
 
 
290 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  42.02 
 
 
292 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  42.02 
 
 
292 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  43.68 
 
 
303 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  41.47 
 
 
292 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  44.22 
 
 
300 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  42.97 
 
 
292 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 
284 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  45.1 
 
 
292 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39 
 
 
283 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  42.69 
 
 
290 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.84 
 
 
295 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  48.89 
 
 
293 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  42.69 
 
 
290 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  41.63 
 
 
292 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  44.02 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  45.42 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  41.86 
 
 
286 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  44.09 
 
 
293 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  44.62 
 
 
287 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  43.94 
 
 
303 aa  198  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  42.91 
 
 
293 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.82 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  45.28 
 
 
305 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  45.28 
 
 
297 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  38.61 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  42.53 
 
 
296 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40.08 
 
 
281 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  41.64 
 
 
371 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  43.91 
 
 
302 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  43.14 
 
 
292 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  41.64 
 
 
375 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  41.92 
 
 
289 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  41.34 
 
 
280 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  43.15 
 
 
293 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  44.88 
 
 
297 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  41.63 
 
 
293 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  44.21 
 
 
292 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  40.89 
 
 
296 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  41.63 
 
 
301 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  43.19 
 
 
293 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.86 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.62 
 
 
294 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  48.74 
 
 
289 aa  188  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  48.74 
 
 
315 aa  188  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  44.17 
 
 
291 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  46.15 
 
 
305 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.34 
 
 
286 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  42.69 
 
 
311 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  41.04 
 
 
313 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  41.64 
 
 
311 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  42.56 
 
 
286 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  42.37 
 
 
296 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>