More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4293 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  100 
 
 		 583 aa  1192    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  43.73 
 
 		 582 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  38.55 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 591 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  38.5 
 
 		 555 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  37.59 
 
 		 559 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  35.01 
 
 		 587 aa  317  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  35.81 
 
 		 564 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  35.93 
 
 		 569 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  32.82 
 
 		 587 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  35.52 
 
 		 580 aa  259  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  28.48 
 
 		 607 aa  193  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  42.51 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  37.19 
 
 		 279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  36.98 
 
 		 281 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  38.8 
 
 		 289 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  31.06 
 
 		 668 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  37.71 
 
 		 310 aa  107  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  38.12 
 
 		 295 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  38.15 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37.14 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  37.14 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  37.14 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  41.94 
 
 		 286 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  35.68 
 
 		 290 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  35.68 
 
 		 290 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  34.22 
 
 		 291 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  37.14 
 
 		 295 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  36 
 
 		 286 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  35.68 
 
 		 290 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  36.07 
 
 		 281 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  34.9 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  34.9 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  34.43 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  37.14 
 
 		 295 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  32.51 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 297 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  36.57 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.64 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  38.01 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.64 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  37.14 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  37.43 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 297 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  37.28 
 
 		 304 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 298 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 290 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 290 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  32.21 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 294 aa  100  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.12 
 
 		 290 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 290 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 290 aa  100  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  35.5 
 
 		 303 aa  100  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 290 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  32.08 
 
 		 303 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 290 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  34.59 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  32.92 
 
 		 303 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  36.47 
 
 		 290 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.12 
 
 		 290 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  36.93 
 
 		 282 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  30.91 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 304 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  36.47 
 
 		 290 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  35.96 
 
 		 311 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  38.31 
 
 		 292 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  37.16 
 
 		 313 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  34.13 
 
 		 317 aa  98.6  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  35.47 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  33.52 
 
 		 304 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  34.02 
 
 		 272 aa  98.2  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  32.76 
 
 		 293 aa  97.8  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  35.8 
 
 		 283 aa  97.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  36.78 
 
 		 306 aa  97.4  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  28.89 
 
 		 281 aa  97.1  8e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  34.5 
 
 		 300 aa  96.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  35.26 
 
 		 294 aa  97.1  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  35.54 
 
 		 296 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  35.8 
 
 		 295 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  34.57 
 
 		 301 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  35.33 
 
 		 298 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  35.75 
 
 		 295 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.82 
 
 		 274 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  38.04 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 269 aa  95.9  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  35.93 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  35.84 
 
 		 313 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>