More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5053 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  100 
 
 		 582 aa  1193    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  43.73 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  38.73 
 
 		 591 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  37.63 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  37.63 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  37.56 
 
 		 574 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  34.49 
 
 		 559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  33.92 
 
 		 555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  34.28 
 
 		 569 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  33.05 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  33.5 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  32.09 
 
 		 580 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  29.95 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  40.08 
 
 		 549 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  30.59 
 
 		 607 aa  163  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  29.09 
 
 		 668 aa  98.2  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  28.72 
 
 		 597 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1601  parB-like partition protein  26.74 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.82 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  29.69 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  31.18 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  33.71 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  34.86 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  28.82 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  31.69 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  31.64 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.87 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  31.43 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  33.14 
 
 		 303 aa  76.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  31.76 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  33.14 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  30.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  27.69 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  28.24 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  31.28 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  32.4 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  32.57 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  27.87 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  26.51 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  28.86 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  29.15 
 
 		 310 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  25.27 
 
 		 305 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  27.92 
 
 		 290 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  28.73 
 
 		 281 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  30.11 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  27.92 
 
 		 290 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  28.49 
 
 		 281 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  29.61 
 
 		 295 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.61 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  30.17 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  27.41 
 
 		 290 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 		 303 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  27.41 
 
 		 290 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  30.11 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  27.41 
 
 		 290 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  30.1 
 
 		 280 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  30.05 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  28.12 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  28.98 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  27.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  27.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  30 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  27.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  27.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  31.52 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  27.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  30 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  30 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  30 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  28.21 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  30 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  27.06 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  30.89 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  30.06 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  30 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  30.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  26.74 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  26.95 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  29.29 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  32.32 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  26.29 
 
 		 322 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  26.77 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  29.48 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  26.67 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  30 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  31.18 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  26.55 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  31.18 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  31.52 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  27.57 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>