More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4412 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  100 
 
 		 580 aa  1191    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  35.02 
 
 		 574 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  35.69 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  33.1 
 
 		 555 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  32.45 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  34.28 
 
 		 554 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  34.28 
 
 		 554 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  35.52 
 
 		 583 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  34.27 
 
 		 591 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  31.36 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  31.9 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  33.04 
 
 		 569 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  29.98 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  40 
 
 		 549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  33.23 
 
 		 607 aa  170  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  31.19 
 
 		 305 aa  91.3  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  31 
 
 		 295 aa  91.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  29.41 
 
 		 293 aa  90.1  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  30.52 
 
 		 295 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  31.19 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  31.19 
 
 		 297 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  31.19 
 
 		 297 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  31.55 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  34.62 
 
 		 305 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  31.94 
 
 		 289 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  31.18 
 
 		 294 aa  87.4  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  30.58 
 
 		 295 aa  87.4  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 310 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  32.98 
 
 		 272 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  30.54 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  34.97 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  34.97 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  31.89 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  35.26 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  30.15 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  34.24 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 304 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.02 
 
 		 304 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  35.09 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  31.35 
 
 		 303 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.67 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  27.48 
 
 		 597 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.67 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.73 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  31.18 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.29 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  31.18 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  34.81 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  32.58 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  31.31 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.41 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  33.33 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  36.24 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  31.19 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  33.33 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 290 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  31.41 
 
 		 326 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  31.07 
 
 		 297 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  31.19 
 
 		 305 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  31.77 
 
 		 314 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  30.39 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  29.63 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  35.39 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  34.94 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  33.13 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  34.25 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  30.36 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  31.22 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  29.41 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  32.26 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  23.6 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  29.7 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  32.65 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  29.44 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  31.22 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  29.27 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  33.76 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  38.94 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  32.35 
 
 		 315 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  31.61 
 
 		 289 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  31.72 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>