More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6529 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  73.52 
 
 		 559 aa  835    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  100 
 
 		 555 aa  1143    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  55.62 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  55.62 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  53.91 
 
 		 574 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  40.65 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 591 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  38.5 
 
 		 583 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  41.62 
 
 		 587 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  40.07 
 
 		 569 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  37.34 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  34.45 
 
 		 582 aa  320  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  33.99 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  44.21 
 
 		 549 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  37.36 
 
 		 297 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  36.81 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  37.36 
 
 		 297 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  38.2 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  37.19 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  36.96 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  36.68 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  37.08 
 
 		 295 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  34.74 
 
 		 290 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  38.04 
 
 		 272 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  34.59 
 
 		 291 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  34.27 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  34.27 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  33.8 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  33.8 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  32.58 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  33.8 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  33.8 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  33.8 
 
 		 290 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  36.21 
 
 		 281 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 290 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 290 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  34.85 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  35.33 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  34.36 
 
 		 286 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 303 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  37.64 
 
 		 297 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  32.12 
 
 		 306 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  37.64 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  34.69 
 
 		 303 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  37.08 
 
 		 297 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  32.39 
 
 		 290 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  34.07 
 
 		 286 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  33.5 
 
 		 286 aa  99.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  34.25 
 
 		 293 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  33.84 
 
 		 284 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  32.97 
 
 		 294 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  27.5 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  36.26 
 
 		 294 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  37.22 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 296 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  32.74 
 
 		 283 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 302 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 274 aa  97.8  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  35.03 
 
 		 296 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  31.89 
 
 		 307 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  34.08 
 
 		 257 aa  97.1  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 297 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 256 aa  97.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  35.48 
 
 		 302 aa  97.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  37.42 
 
 		 284 aa  97.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  34.25 
 
 		 292 aa  97.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  28.7 
 
 		 279 aa  97.1  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  35.26 
 
 		 291 aa  96.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  32.26 
 
 		 294 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  36.26 
 
 		 295 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  34.65 
 
 		 329 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  33.52 
 
 		 283 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  34.46 
 
 		 296 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 286 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 286 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 310 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  33.15 
 
 		 293 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  33.52 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  30.22 
 
 		 303 aa  95.1  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  33.52 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  28.08 
 
 		 605 aa  94.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0440  stage 0 sporulation protein J  29.52 
 
 		 260 aa  94.7  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.216076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  33.7 
 
 		 288 aa  94.4  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  37.16 
 
 		 293 aa  94.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  37.16 
 
 		 293 aa  94.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  33.7 
 
 		 290 aa  94.4  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  30 
 
 		 294 aa  94.4  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  36.02 
 
 		 295 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>