More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5020 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  100 
 
 		 591 aa  1218    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  39.46 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  39.46 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  38.28 
 
 		 574 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  38.89 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 555 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  36.68 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  37.48 
 
 		 564 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  38.07 
 
 		 582 aa  353  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  34.57 
 
 		 587 aa  323  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  37.12 
 
 		 569 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  34.87 
 
 		 587 aa  303  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  34.27 
 
 		 580 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  46.43 
 
 		 549 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  29.14 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  39.53 
 
 		 279 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  36.81 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 296 aa  107  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 279 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  36.1 
 
 		 291 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 279 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  37.93 
 
 		 286 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.42 
 
 		 290 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.42 
 
 		 288 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  33.2 
 
 		 297 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  33.2 
 
 		 305 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  33.2 
 
 		 297 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  32.49 
 
 		 295 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  37.21 
 
 		 268 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.25 
 
 		 289 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.72 
 
 		 304 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  39.43 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  31.22 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  36.42 
 
 		 306 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  37.57 
 
 		 281 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  37.23 
 
 		 295 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 310 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  36.78 
 
 		 272 aa  101  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  29.3 
 
 		 597 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  36 
 
 		 362 aa  100  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.32 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.32 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  36.63 
 
 		 297 aa  99.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 281 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.32 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  31.3 
 
 		 289 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 280 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  33.16 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  33.16 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  37.43 
 
 		 280 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  33.16 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  33.16 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  32.32 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 295 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  33.16 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  34.52 
 
 		 256 aa  99.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.32 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  36.63 
 
 		 286 aa  99  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  35.84 
 
 		 295 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  35.54 
 
 		 294 aa  99.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  32.8 
 
 		 305 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  34.63 
 
 		 302 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  36.05 
 
 		 295 aa  98.2  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  37.5 
 
 		 292 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  38.12 
 
 		 311 aa  97.8  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 272 aa  97.8  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  37.36 
 
 		 295 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  35.06 
 
 		 294 aa  97.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  36.93 
 
 		 292 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  36.93 
 
 		 292 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  34.83 
 
 		 284 aa  97.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  32.4 
 
 		 297 aa  97.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 286 aa  97.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.31 
 
 		 305 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  35.36 
 
 		 283 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  35.56 
 
 		 283 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  36.78 
 
 		 292 aa  96.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  35.2 
 
 		 321 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  33.17 
 
 		 281 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  36.78 
 
 		 292 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  36.81 
 
 		 304 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  33.33 
 
 		 293 aa  95.9  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  35.68 
 
 		 303 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  35.06 
 
 		 294 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  36.21 
 
 		 301 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  36.21 
 
 		 289 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  37.1 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  36.22 
 
 		 310 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  34.29 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  38.51 
 
 		 282 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  37.36 
 
 		 318 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  36.36 
 
 		 303 aa  95.1  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>