More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2542 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  100 
 
 		 587 aa  1196    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  62.97 
 
 		 587 aa  738    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  40.29 
 
 		 554 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  40.29 
 
 		 554 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  40 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  40.43 
 
 		 559 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  37.63 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 591 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  34.38 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  32.82 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  35.66 
 
 		 569 aa  273  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  29.17 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  31.9 
 
 		 580 aa  231  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  45.61 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  28.74 
 
 		 607 aa  173  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  37.06 
 
 		 294 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  33.89 
 
 		 279 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 279 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 279 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  38.29 
 
 		 304 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  38.69 
 
 		 296 aa  97.4  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 300 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  38.71 
 
 		 305 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 297 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  36.46 
 
 		 272 aa  94.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  38.8 
 
 		 305 aa  94.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  38.71 
 
 		 297 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  38.24 
 
 		 295 aa  93.6  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  34.08 
 
 		 289 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  34.1 
 
 		 281 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  37.65 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.19 
 
 		 296 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  30.24 
 
 		 263 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.19 
 
 		 301 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  30.2 
 
 		 597 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  30.73 
 
 		 263 aa  90.5  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  35.57 
 
 		 310 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 290 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 290 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  34.24 
 
 		 290 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  34.24 
 
 		 290 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  37.09 
 
 		 299 aa  90.1  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  33.73 
 
 		 293 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  33.73 
 
 		 293 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  36.22 
 
 		 295 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.26 
 
 		 310 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  35.88 
 
 		 290 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 		 306 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  35.29 
 
 		 290 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  35.29 
 
 		 290 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  33.7 
 
 		 290 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  33.7 
 
 		 294 aa  88.2  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 286 aa  88.2  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  35.14 
 
 		 295 aa  88.2  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 297 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  33.7 
 
 		 290 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  38.71 
 
 		 305 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  36.13 
 
 		 303 aa  87.4  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  35.5 
 
 		 309 aa  87  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  37.7 
 
 		 297 aa  87  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  36.31 
 
 		 304 aa  87  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  34.25 
 
 		 305 aa  87  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.98 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 274 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  34.24 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  33.7 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  34.46 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  33.73 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  34.66 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  36.25 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  36.18 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  33.51 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  31.52 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  36.71 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  34.87 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  37.33 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  37.33 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  36.47 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  35.63 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  35.63 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  28.92 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  35.29 
 
 		 300 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  34.18 
 
 		 286 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  35.36 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  31.9 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  33.76 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  31.52 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  34.81 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  36.81 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>