278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1149 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
422 aa  842    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  52.74 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  51.45 
 
 
462 aa  308  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  51.91 
 
 
442 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  51.8 
 
 
483 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0719  ParB domain protein nuclease  38.64 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.320952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  26.51 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  28.29 
 
 
298 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  27.44 
 
 
294 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  26.83 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  29.95 
 
 
572 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  26.32 
 
 
597 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  30.41 
 
 
290 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.82 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3031  ParB domain protein nuclease  27.85 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  26.67 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  27.91 
 
 
296 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  30.61 
 
 
322 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  29.52 
 
 
291 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  38.82 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  28.49 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  37.11 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  28.84 
 
 
297 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  28.65 
 
 
290 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.22 
 
 
310 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  27.91 
 
 
304 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  26.77 
 
 
305 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  29.82 
 
 
290 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  26.98 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  27.17 
 
 
565 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  27.91 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.11 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  27.91 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  27.72 
 
 
282 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  28.07 
 
 
290 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  26.98 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  27.44 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  29.67 
 
 
304 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  29.75 
 
 
303 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  28.18 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  28.07 
 
 
290 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  25.81 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  29.75 
 
 
303 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  28.57 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  26.7 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  27.92 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  24.75 
 
 
272 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  28.18 
 
 
263 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  27.92 
 
 
295 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  27.92 
 
 
305 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  27.92 
 
 
297 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  27.92 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  25.42 
 
 
294 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  27.92 
 
 
297 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  26.92 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  27.67 
 
 
303 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1535  ParB domain protein nuclease  39.71 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  35.11 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  29.07 
 
 
290 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  26.8 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  29.63 
 
 
302 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  25.91 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  26.51 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  26.09 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  27.87 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  25.38 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  27.51 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  27.89 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  30.36 
 
 
311 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  30.95 
 
 
288 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  34.88 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  27.91 
 
 
306 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  34.88 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  23.11 
 
 
283 aa  54.3  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  29.1 
 
 
311 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  24.44 
 
 
255 aa  54.3  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  28.74 
 
 
306 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3031  ParB domain protein nuclease  47.06 
 
 
308 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  27.56 
 
 
303 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  28.72 
 
 
355 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  25.94 
 
 
331 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  25.25 
 
 
284 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  27.27 
 
 
283 aa  53.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  29.08 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  35.29 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  26.34 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  29.94 
 
 
313 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  25.58 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  30.77 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  25.63 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.19 
 
 
269 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  28.57 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  36.47 
 
 
178 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>