21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1622 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  32.26 
 
 		 507 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  30.89 
 
 		 426 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  30.29 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  27.5 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  25.25 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  27.01 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  27.91 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3640  ParB-like nuclease  29.28 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  29.67 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  26.06 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  24.18 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  36.78 
 
 		 434 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  23.37 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  28.85 
 
 		 447 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  27.42 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0719  ParB domain protein nuclease  25.71 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.320952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  25.82 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  23.53 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1731  hypothetical protein  36.51 
 
 		 100 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.085232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>