46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2604 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  100 
 
 		 401 aa  835    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  36.52 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  34.59 
 
 		 507 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  40.12 
 
 		 224 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  38.2 
 
 		 226 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  38.2 
 
 		 216 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  37.5 
 
 		 186 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  34.48 
 
 		 211 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  32.77 
 
 		 229 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  33.53 
 
 		 208 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  34.07 
 
 		 201 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  34.07 
 
 		 201 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  34.64 
 
 		 193 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  34.46 
 
 		 208 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  34.27 
 
 		 200 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  32.77 
 
 		 188 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  34.81 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  32.4 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  32.95 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  30.29 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  32.39 
 
 		 187 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  25.83 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  25.61 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  30.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  32.16 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  32.81 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  29.38 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3640  ParB-like nuclease  24.7 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  39.32 
 
 		 130 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  27.01 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  26.52 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  27.11 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  26.82 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  26.89 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  24.35 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  25.59 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  29.41 
 
 		 168 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  35.56 
 
 		 122 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  26.96 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  26.09 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  26.91 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  26.7 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  26.22 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  25.65 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  25.65 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0135  nuclease  28.57 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00112116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>